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Facoltà di Scienze Agrarie e Alimentari Università degli Studi di Milano
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Genomica
Codice: G6106-
Docente:  Carlo Massimo Pozzi
Anno di corso: 
Quadrimestre/semestre: 
CFU: 
Articolazione dei CFU: Lezioni frontali: 6
Obiettivi formativi:  Il corso fornisce agli strumenti gli strumenti di genomica e di genomica funzionare necessari per studiare i genomi e la funzione genica, in sistemi vegetali. Il corso mette lo studente in grado di comprendere le tecniche della genomica strutturale e della genomica funzionale. Inoltre, provvede una base metodologica per applicare queste tecniche nell'ambito del miglioramento genetico vegetale.
Competenze acquisite:  Lo studente acquisirà competenze in genomica strutturale e genomica funzionale.
Sintesi del programma:  Programma.
La genomica come shift paradigmatico. Analisi dei genomi e
tecnologie utili per individuare geni e trascritti. Struttura del
genoma vegetale. Genetica inversa e gene discovery. Relazioni tra
genomica e fenomica. Principi di genomica funzionale. Utilizzo
della genomica per il breeding vegetale. Bioinformatica e
genomica.
Programma:  Program
Timing is provided as indicative and may vary according to didactic necessities.
introduction (2 hours)
genomics as a paradigm shift (1 hours)
genome structure and how it is decoded (advanced sequencing techniques)(5 hours)
genome decoding: reverse genetics (5 hours)
gene discovery (5 hours)
phenomics (2 hours)
RNAi and reverse genetics (3 hours)
Principles of functional genomics (6 hours)
Microarray as a specific tool in functional genomics (3 hours)
How genomics is used in breeding (8 hours)
Bioinformatics for genomics (6 hours)
Special tools and techniques (2 hours)
Prerequisiti:  1. genetica formale (leggi di Mendel)
2. ricombinazione e suo uso nella creazione di mappe molecolari
3. marcatori molecolari
4. QTL e loro mappaggio
5. metodi di base per il sequenziamento di acidi nucleici
6. trasformazione delle piante
7. principi di gene editing (soprattutto uso di CRISPR/Cas9)
8. principi di miglioramento genetico (miglioramento genetico di specie vegetali allogame e autogame; uso di marcatori per programmi di breeding assistito; etc.)
Propedeuticità:  Info non disponibile
Materiale didattico:  Gli argomenti delle lezioni tratteranno gli ultimi sviluppi nel campo
della genomica non ancora descritti nei libri di testo. Il testo
introduttivo è "Genetica e genomica", di Barcaccia e Falcinelli. Il
professore fornirà file per tutte le lezioni e indicherà gli articoli
scientifici da leggere per approfondire le tematiche trattate.
Per favore consultate il sito ARIEL per slides, articoli e testi
proposti.
Modalità d'esame e altre info:  L'esame è scritto quando si superino i 4 iscritti ad un dato appello.
Vengono poste 6 domande, ognuna delle quali viene valutata 0-5.
Le domande sono aperte e l'argomento è di solito piuttosto
generale. L'esame orale dura 30 minuti e vengono poste 6
domande, di carattere piuttosto generale.
DOWNLOAD
Programma di Genomica (versione in pdf)
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